PMI Science внедряет анализ больших данных в системную биологию

PMI Science внедряет анализ больших данных в системную биологию - фото 1Научный сотрудник PMI Science Лусине Хачатрян выступила на конференции OpenBio с докладом о том, как научная краудсорсинговая платформа помогает ученым обмениваться опытом и проверять свои гипотезы, а компании - задействовать лучших специалистов со всего мира для проведения исследований.


Лусине Хачатрян приняла участие в сессии «Работаем с корпорацией» в рамках конференции OpenBio для молодых ученых и создателей стартапов в научной сфере. Фармацевтические и медицинские корпорации рассказывали о преимуществах сотрудничества с учеными и предпринимателями.
В качестве примера такой коллаборации, который использует компания PMI Science, Лусине Хачатрян привела проект sbv IMPROVER. Это - краудсорсинг-платформа для анализа больших данных в системной биологии. Исследователям это помогает оценить свои научные разработки, а компании выбрать наиболее перспективные исследования.
«PMI сопровождает процесс разработки инновационных продуктов большим количеством исследований, которые компания старается сделать прозрачными для научного сообщества. Сначала была создана онлайн-платформа INTERVALS – открытая платформа для анализа данных. Ученые видят все исходные данные и могут их оценить. На платформе sbv IMPROVER проводится независимая проверка гипотез, она используется как дополнительная система экспертной оценки», - рассказала Лусине Хачатрян.
По словам Лусине, в исследованиях используется двойной слепой подход. Система оценки определена заранее и всем доступна. Контроль осуществляет независимая экспертная группа в лице профессоров ведущих мировых университетов.
В недавнем соревновании участники должны были, используя только метагеномные данные, полученные из образцов стула пациентов, определить образцы больных людей при помощи технологий машинного обучения. Участники не знали диагнозы людей, они сами предсказывали их с помощью своих моделей. Условием победы было точное предсказание диагноза по 104 образцам.
Соревнование завершилось победой российской команды. Молодые ученые из Университета ИТМО Артем Иванов и Владимир Ульянцев стали победителями сразу в 2 номинациях.
«Участвовало несколько стартапов, но их всех обошла команда ИТМО. Участвовала даже серьезная компания, которая работает на рынке машинного обучения, но результат российской команды оказался лучше», - рассказала Лусине Хачатрян.
Платформа sbv IMPROVER работает с 2011 года, за это время она провела 12 научных соревнований, 25 статей было опубликовано в ведущих мировых журналах, еще 5 статей в процессе подготовки. Для участников регулярно проводятся симпозиумы.

Добавить комментарий


Защитный код
Обновить