По словам специалистов Мосприроды, на водных объектах можно встретить на природных территориях Москвы можно встретить бобров, водяных полевок, чернетей хохлатых, гоголей, сизых чаек и других представителей Красной книги Москвы.
Комплекс водных объектов Москвы – это около 200 рек и ручьев и более 600 прудов. Основная водная артерия – река Москва. В столице есть водоёмы естественного и искусственного происхождения, входящих в единую гидрографическую систему. Причём, лишь немногие из них являются естественными озёрами, например, на ООПТ это Косинские озера Белое, Чёрное и Святое, Чёрное озеро в Крюковском лесопарке. Это верховые озёра ледникового происхождения, не имеющие инженерных сооружений. Остальные водоёмы – это пруды, созданные путем устройства подпорных сооружений и выемок в руслах, на поймах рек и ручьев и на водоразделах.
Специалисты Мосприроды регулярно проводят учёты водоплавающих птиц на водных объектах. Недавно прошел зимний учёт водной и околоводной орнитофауны, который показал, что на природных территориях Москвы зимовать осталось 8420 водоплавающих птиц. Большая часть из них – кряквы: 8009 особей, 3749 уток (самок) и 4260 селезней (самцов). Также на природных территориях были замечены: 250 озёрных чаек, 90 огарей, 28 сизых чаек, 18 гоголей обыкновенных, 17 чернетей хохлатых, четыре казарки белощёких, две лутки, один гусь белолобый, одна шилохвость гибридной формы. Из этих видов птиц четыре – представители Красной книги Москвы: озёрные и сизые чайки (2-я категория), чернети хохлатые (3-я категория), гоголи (5-я категория).
На водных объектах Москвы специалистами регулярно фиксируются и млекопитающие обитатели: бобры, ондатры, водяные полевки. Последние занесены в Красную книгу Москвы под 3 категорией.
Особенность водных объектов Москвы в том, что они испытывают мощные антропогенные нагрузки, но при этом осуществляют рекреационные функции, используются для хозяйственно-питьевого и технического водоснабжения, судоходства и, конечно, служат домом для многих уникальных представителей фауны. Поэтому относиться к ним следует очень бережно.